Embrapa Agroenergia
Organização
Embrapa Agroenergia
Sequenciador
Modelo: .
Marca: Illumina
Função
Sequenciamento de alto rendimento de fragmentos curtos a médios de DNA através do método de síntese (SBS) - output de até 120 GB de dados por corrida. A plataforma Illumina vem sendo adotada como padrão para um grande número de aplicações em genômica, transcriptômica e metagenômica. Aplicações: Análise de interação DNA-Proteína. Sequenciamento de: Análise de interação DNA-Proteína; Exomas; Amplicons e painéis gênicos; RNA; Regiões metiladas e Metagenômico 16S.
Sequenciador PacBio (3ª GERAÇÃO)
Modelo: .
Marca: Pacific Biosciences
Função
O equipamento PacBio realiza sequenciamento de alto rendimento de fragmentos longos de DNA através do método de sequenciamento de molécula única em tempo real (SMRT) - output de até 5 a 10 GB por célula SMRT. O método da PacBio permite a detecção da amplificação de fragmentos individualmente, sem a necessidade de amplificação. Isso reduz os erros causados pela amplificação, e permite a detecção de bases modificadas. Aplicações: Determinação de variantes em uma população e Detecção de modificações no DNA (epigenética). Sequenciamento: Sequenciamento de novo de genomas inteiros, por exemplo, de humanos, plantas, animais e micro-organismo e também a detectar variantes estruturais; RNA (RNAseq); Amplicons ; Metagenoma e Transcriptoma.
Tapestation
Modelo: .
Marca: .
Função
Sistema automatizado para análise eletroforética de biomoléculas, sendo capaz de analisar a integridade de DNA genômico, processo indispensável para a análise de amostras visando o Sequenciamento de Nova Geração (NGS). Oferece processamento automatizado de amostras visando o controle de qualidade das mesmas. Aplicações: Controle de qualidade de DNA genômico (gDNA), incluindo número de integridade de DNA ; Controle de qualidade de DNA celular livre com pureza %c fDNA e Controle de qualidade de biblioteca de NGS e análise de bibliotecas amplificadas. Aplicações adicionais incluem: Reação em cadeia da polimerase (PCR) e análise de fragmento de PCR multiplex, bem como controle de qualidade de produtos de PCR quantitativos.
Infraestrutura em síntese química
Modelo:
Marca:
Função
Reatores de milicanais (bancada e piloto); reatores Parr; Central analítica (HPLC, GC, GCMS, FRX, DRX, FTIR, RAMAN, etc); moinho Mazzuco; Dynamic shape analyzer; Drop shape analyzer; Mastersizer; Tensiometer; Litesizer; Spinning drop; Turbiscan
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Universitária – Rio de Janeiro – RJCEP: 21941-857