Organização do Igor
Organização
Organização do Igor
Sequenciador Sanger
Modelo: .
Marca: .
Função
O sequenciador de DNA Sanger (analisador de DNA 3730) de 48 capilares tem por objetivo realizar análises genéticas de alto rendimento, permitindo análise de fragmentos de DNA, como microssatélites, AFLP, análise SNP, detecção de mutação e sequenciamento tradicional de DNA. O equipamento à base de eletroforese capilar, onde o DNA-alvo é copiado muitas vezes, produzindo fragmentos de comprimentos diferentes (até 900 pares de base). Tem a capacidade de processar 1000 amostras ou 700 mil pares de base por dia. Dessa forma é possível realizar o sequenciamento de partes do genoma. Aplicações: ; Sequenciamento de novo ; Sequenciamento de DNA ; Validação de sequenciamento de próxima geração ; Sequenciamento HLA ; Sequenciamento Microbiano e Sequenciamento Mitocondrial
Sequenciador
Modelo: .
Marca: Illumina
Função
Sequenciamento de alto rendimento de fragmentos curtos a médios de DNA através do método de síntese (SBS) - output de até 120 GB de dados por corrida. A plataforma Illumina vem sendo adotada como padrão para um grande número de aplicações em genômica, transcriptômica e metagenômica. Aplicações: Análise de interação DNA-Proteína. Sequenciamento de: Análise de interação DNA-Proteína; Exomas; Amplicons e painéis gênicos; RNA; Regiões metiladas e Metagenômico 16S.
Sequenciador PacBio (3ª GERAÇÃO)
Modelo: .
Marca: Pacific Biosciences
Função
O equipamento PacBio realiza sequenciamento de alto rendimento de fragmentos longos de DNA através do método de sequenciamento de molécula única em tempo real (SMRT) - output de até 5 a 10 GB por célula SMRT. O método da PacBio permite a detecção da amplificação de fragmentos individualmente, sem a necessidade de amplificação. Isso reduz os erros causados pela amplificação, e permite a detecção de bases modificadas. Aplicações: Determinação de variantes em uma população e Detecção de modificações no DNA (epigenética). Sequenciamento: Sequenciamento de novo de genomas inteiros, por exemplo, de humanos, plantas, animais e micro-organismo e também a detectar variantes estruturais; RNA (RNAseq); Amplicons ; Metagenoma e Transcriptoma.
Tapestation
Modelo: .
Marca: .
Função
Sistema automatizado para análise eletroforética de biomoléculas, sendo capaz de analisar a integridade de DNA genômico, processo indispensável para a análise de amostras visando o Sequenciamento de Nova Geração (NGS). Oferece processamento automatizado de amostras visando o controle de qualidade das mesmas. Aplicações: Controle de qualidade de DNA genômico (gDNA), incluindo número de integridade de DNA ; Controle de qualidade de DNA celular livre com pureza %c fDNA e Controle de qualidade de biblioteca de NGS e análise de bibliotecas amplificadas. Aplicações adicionais incluem: Reação em cadeia da polimerase (PCR) e análise de fragmento de PCR multiplex, bem como controle de qualidade de produtos de PCR quantitativos.
Universitária – Rio de Janeiro – RJCEP: 21941-857